В соответствии с положениями п. 1 и 2 ст. 412 Налогового кодекса РК при совершении оборота по реализации товаров, работ, услуг обязаны выписать счет-фактуру в электронной форме:
- плательщики НДС, предусмотренные пп. 1) п. 1 ст. 367 Налогового кодекса РК;
- налогоплательщики в случаях, предусмотренных нормативными правовыми актами РК, принятыми в целях реализации международных договоров, ратифицированных РК (т.е. в случае реализации товара, входящего в Перечень ВТО);
- комиссионер, не являющийся плательщиком НДС, в случаях, установленных ст. 416 Налогового кодекса РК;
- экспедитор, не являющийся плательщиком НДС, в случаях, установленных ст. 415 Налогового кодекса РК;
- налогоплательщики в случае реализации импортированных товаров;
- структурное подразделение уполномоченного органа в области государственного материального резерва при выпуске им товаров из государственного материального резерва.
Таким образом, вы обязаны выписывать ЭСФ в отношении оборотов по реализации ваших товаров в случае, если:
- Ваше ТОО является плательщиком НДС;
- Ваше ТОО не является плательщиком НДС, но ваши товары ранее были импортированы на территорию РК либо их коды ТН ВЭД входят в Перечень изъятий ВТО.
Согласно положениям п. 3-1 ст. 412 Налогового кодекса РК перечень товаров, по которым ЭСФ выписываются посредством модуля "Виртуальный склад" ИС ЭСФ, утверждается уполномоченным органом и размещается на его интернет-ресурсе.
Перечень товаров виртуального склада утвержден Приказом Первого заместителя Премьер-Министра РК – Министра финансов РК от 23 апреля 2019 года № 384.
Соответственно, если коды ТН ВЭД товаров входят в перечень виртуального склада, то при их реализации ЭСФ должен быть выписан посредством модуля "Виртуальный склад".
Принимая во внимание положения пп. 1) п. 13 ст. 412 Налогового кодекса РК, выписка счета-фактуры, за исключением случаев, предусмотренных пп. 2), 5) и 7) части первой п. 1 ст. 412 Налогового кодекса РК, не требуется в случаях реализации товаров, работ, услуг, расчеты за которые осуществляются:
- наличными деньгами с предоставлением покупателю чека ККМ и (или) через терминалы оплаты услуг;
- с применением оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек.
Т.е. если ваши товары не являются импортированными или не входят в Перечень изъятий ВТО, при этом расчет физическим лицом-покупателем за них осуществляется наличными или платежом с использованием платежной карты, то выписка ЭСФ, в т.ч. через модуль "Виртуальный склад", не требуется.
На основании положений п. 89-91 Правил выписки ЭСФ, утвержденных Приказом Первого заместителя Премьер-Министра РК – Министра финансов Республики Казахстан от 22 апреля 2019 года № 370 (далее по тексту – Правила № 370):
89. При реализации физическим лицам товаров, включенных в перечень, расчеты за которые осуществляются:
- наличными деньгами с предоставлением чека ККМ и (или) через терминалы оплаты услуг;
- с применением оборудования (устройства), предназначенного для осуществления платежей с использованием платежных карточек;
- электронными деньгами или с использованием средств электронного платежа.
Выписка счета-фактуры в электронной форме производится в соответствии с пунктом 90 Правил № 370.
90. Поставщик, применяющий один из расчетов, предусмотренный пунктом 89 настоящих Правил, выписывает ЭСФ на весь оборот за день, по каждому виду товара, с заполнением отдельных строк, с указанием в Разделе С "Реквизиты получателя":
- в строке 17 "Получатель" – "Физические лица" (данная строка заполняется автоматически);
- в строке 18 "Адрес места нахождения" – "Розничная торговля" (данная строка заполняется автоматически);
- в ячейке "I" строки 20 "Категория получателя" раздела С "Реквизит получателя" – делается отметка.
В случае необходимости может быть выписано несколько ЭСФ.
91. Положения п. 90 Правил № 370 применяются также при реализации своим работникам в счет заработной платы товара, ранее учтенного в качестве основного средства в бухгалтерском учете. При этом положения настоящего пункта применяются к товарам как включенным в перечень, так и не включенным в перечень.
Таким образом, если реализуемые вами товары являются импортированными или входят в Перечень изъятий ВТО, при этом расчет физическим лицом-покупателем за них осуществляется наличными или платежом с использованием платежной карты, то выписка ЭСФ обязательна, но обезличено, на "Физическое лицо".
Также см. разъяснения КГД МФ РК.